Na formação dos discentes do curso de Biomedicina a FBM dispõe de diferentes laboratórios conveniados ao curso. Nesses laboratórios são oferecidos os estágios rotatórios, os estágios de pesquisa e de extensão, além dos estágios supervisionados. Os laboratórios pertencem à rede pública (Instituto Evandro Chagas, Núcleo de Medicina Tropical, HEMOPA, Hospital Universitário João de Barros Barreto etc.) ou à rede privada (Hospital Beneficente de Belém, Hospital Adntista de Belém, Laboratório Amaral Costa, Laboratório Paulo Azevedo, Clnica So Diagnósticos, UNIMED, Clínica Dimagem etc.).